由于破坏了生精上皮，从而导致精子畸形、死亡，直至无精子，甲酸棉酚和醋酸棉酚均能保持抗生育活性，且副作用略有降低，棉酚右旋体无效，左旋体为活性成分，因此，左旋棉酚的作用为棉酚的2倍，该品除用作口服男用避孕药外，还可作外用杀精子剂；还用于治疗妇科疾病，包括月经过多或失调、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等，药理作用：棉酚口服后，药物在体内的分布广泛，由于它难以通过血脑屏障及血睾屏障，以致在脑组织中或睾丸内的浓度极低。

很久性无精子症，棉酚可致生精上皮萎缩，然而个体间的差异很大，有些人用后生精上皮的形态不发生明显的变化；有少数人却可发生明显萎缩，部分损害时仍有可能恢复生育力，但若全部受损则不能恢复，而造成很久性不育，事先不能预测其发生；一旦发生后，又无有效的治疗方法，故预防其发生非常重要，方法利用乙醚超声萃取法提取棉花根皮中的棉酚，洗涤、浓缩得到棉酚粗产品；研究了各种实验条件对棉酚产率的影响，采用分光光度法测定该成分含量，作为评价指标。

超微结构研究表明，棉酚引起线粒体肿胀，嵴断裂、固缩、严重空泡化及溃破等，线粒体是细胞呼吸、能量供应和氧化、磷酸化的重要细胞器，线粒体损伤导致细胞死亡，此外还有一些棉酚的抗肿瘤机制，如某些对烷化剂耐药的肿瘤细胞系，其机制是因为增加了谷胱甘肽S-转移酶活性，从而加速药物灭活，抑制谷胱甘肽氧化还原系统的某些酶可影响细胞对烷化剂的敏感性，棉酚对谷胱甘肽转移酶及其pi同功酶表现强有力的抑制，与烷化剂合用，可增加其抗癌功能。