洁净实验室使用的空调通风系统主要由空气处理设备、粗高效过滤器、空气输送设施和局部净化设备组成，它们的类型和功能各不相同。空气处理设备:一般空气处理设备是由空调(AHU)、新风机组(MAU)、循环机组(RAU)组成的成套机组，常用于空调净化系统中的空气热湿交换和空气净化处理。适合有一定规模的实验室净化工程，但是需要其他过滤器和净化装置的整体配合，所以投资比较高。相对较小的实验室空气处理设备由分立的小型设备组成，比如利用冷暖空调作为冷热源，对空气的温湿度进行简单的处理，然后配备风机过滤机组(FFU)对空气进行净化，这是一种相对简单的净化方案。

实验室净化技术夹层分为顶层技术夹层和房间技术夹层。顶部技术夹层的供回风管截面较大，一般布置在夹层顶部，下方布置电气管线。当地板承载能力比较强的时候，可以在上面布置过滤器和排风设备。技术夹层相对于房间的顶层，可以减少夹层的布线和高度，风扇和动力设备的配电可以设置在较低的过道。洁净室的上通道也可以作为上层的下通道。技术通道的设计布局一般是垂直和笔直的，也可以放置一些不适合洁净室的辅助设备。甚至可以作为一般的回风风道或静压箱，有的还可以配光管散热器。因为这些技术壁垒(墙)大多采用轻质隔墙，所以在技术调整的时候可以很容易的调整。

实验室净化工程不仅起到保护实验样品安全的作用，也是保证实验成功和实验人员安全的重要措施之一。实验室净化工程是将实验室的某一区域开辟出来，专门用于建造空气洁净，对实验环境要求相对较高的实验室或无菌室。实验室净化工程系统其实和传统的洁净室系统差不多，只是洁净室的压力、微生物控制、温湿度控制比工业洁净室更严格。常见的实验室净化工程装修材料有夹层彩钢板、钢化玻璃、防火板等。洁净实验室必须按照洁净室施工及验收标准，采用密封性好、不产生粉尘的材料进行隔断和吊顶装修。洁净实验室的通风系统一般采用组合式空调机组。